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细胞系与动物模型质量控制中，传统方案是采用单一方法学对已知遗传变异情况或少数几种微生物污染情况进行检测。序祯达的高通量细胞系与动物模型质量控制方案，对样本全部变异以及数万种数据库中已知微生物进行检测，可以实现高灵敏度，高特异性和全面的检测与评估，充分满足企业生产和研发过程中对样本质量控制的严格要求。同时，为满足IND和产品上市申报要求，相关检测方法均可以按照GLP标准进行验证及检测。

案例 1

细胞系鉴定

《中国药典》要求，药物开发和生产时，对细胞系进行准确的细胞系鉴定，传统STR仅适合具有已知STR图谱的细胞系，但在亲属或相近遗传背景的样本中，其准确性不高，尤其是有限品系的近交系实验小鼠。序祯达针对细胞系的特异性基因序列进行特征富集，通过高通量测序方法精准鉴定细胞系，提高鉴定精度和灵活性。

以中国仓鼠细胞卵巢系鉴定为例，利用中国仓鼠基因组中特异性基因序列，设计多重PCR引物，鉴定中国仓鼠细胞系，准确性达100%。

菌株测序

中国药典》要求，药物开发和生产时，对工程菌株进行准确的种内鉴定，传统方法往往操作复杂且耗时长。序祯达利用高通量全基因组测序，自主研发了多位点序列分型技术，实现快速、高通量的种内菌株鉴定。

以大肠杆菌为例，可快速、有效区分128种工程大肠杆菌，及1570种NCBI大肠杆菌菌株。全面覆盖现有大肠杆菌菌种类型。

（大肠杆菌菌株鉴定图）

纵坐标为位点比对率，横坐标为大肠杆菌菌株，红色为100%比对的菌株

微生物污染检测

基于《药品生产质量管理规范》要求，传统的外源微生物分子检测采用sanger、qPCR、ddPCR方法，可以检测常规的微生物、支原体、衣原体污染，但其一次检测的目标有限，并且无法检测出方法学未覆盖的微生物等污染物。

序祯达宏基因组微生物污染检测，利用全基因组测序，检测样本所有核酸，比对最新数据库，全面、精准检测微生物污染。通过优化的背景控制技术，序列比对算法，以及定期更新的专属数据库和人工审核流程，更准确的获得微生物的种属信息。检测范围包含细菌 9471 种、真菌 1854 种、病毒 15752 种，支原体/衣原体104种，共计 27181 种微生物。

药物筛选与药效研究

通过细胞系筛选潜在药物和研究药代动力学是药物研发的重要环节，经常需要一次性筛选数百种化合物或测试成百上千种用药组合。急需一种通量高，成本低的获取细胞样本RNA表达量变化的方法，用药评估药效和研究药物机理。

序祯达针对高通量药物筛选的需求推出了高通量RNA-seq解决方案，可直接在细胞培养的384孔板中，一次性检测384个样本的RNA表达。检测结果覆盖所有基因转录组表达信息，可用于分析复杂的生物学功能及通路变化，评价药物作用机理、药物作用的潜在靶点、预测药物的副作用、评估药物联合使用的可能性、挖掘老药新用的潜力，可以极大的简化和加速药物筛选与药效研究。

案例 2

高通量药物筛选（HT-RNA-seq）

通过孔标签（Well Barcode）以及UMI定量技术，将384孔板中的样本混合建库，结合生物信息学，可以得到每个样本的RNA表达数据。

•样本需求少，细胞 2000-10000个

•速度快，通量高，成本低

•结果准确，表达量无PCR偏向性

•与传统mRNA检测相比，表达量结果一致性高（图）

1S：HT-RNA-seq 2S：传统mRNA-seq

A549细胞使用LSD1药物和DMSO（control）处理，使用HT-RNA-seq方法（1S）和传统mRNA-seq（2S）进行转录组测序，各进行4次重复，分析其转录组结果的一致性，1S和2S方法的一致性>0.94。

药物靶点发现与验证

序祯达多组学平台，支持研究者在细胞、类器官、动物水平进行靶点和药效验证研究。支持基因组、转录组、表观组，以及蛋白组数据整合，通过自主搭建的整合分析算法或机器学习算法，结合相关公共数据库的信息，多维度、全面的分析疾病致病机理、药物作用机制、评价药物作用机理、药物作用的潜在靶点、预测药物的副作用、评估药物联合使用的可能性，更精准的发现和验证药物靶点、挖掘老药新用的潜力。

案例 3：PDX模型的药物靶点及药效研究

与肿瘤组织一致性评估

基于高通量全基因组测序，通过分析SNV、CNV、SV，评估模型与肿瘤组织一致性。